fix: recover empty database migrations and persist Docker icons

apps/api/.env.example

@@ -89,3 +89,5 @@ NETWORK_RATE_LIMIT_WINDOW_MS=900000
 NETWORK_AUTH_RATE_LIMIT_MAX=30
 # 每个来源在窗口内访问单个 OAuth 授权、令牌、撤销或注册端点的次数。
 MCP_AUTH_RATE_LIMIT_MAX=100
+# Optional filesystem icon persistence; Docker configures /app/data/icons.
+ICON_STORAGE_DIR=